İstanbul Ticaret Üniversitesi Endüstri Mühendisliği bölümü Mühendislik ve Mimarlık fakültesi bünyesinde 2001 yılında Türkçe eğitim dili ile eğitim-öğretime başlamıştır. İlk öğrencilerini 2002 yılında Üsküdar Yerleşkesinde alan bölüm ilk mezunlarını 2006 yılında vermiştir. 2007 Yılında Bölümümüz, kurucu vakfın yaptığı yatırım sonrası şu anda da hizmet verdiği Küçükyalı Yerleşkesine taşınmıştır. 2011-2012 Öğretim Döneminden itibaren mezuniyet başarı notu hesabında ders kredisi yerine AKTS değerleri kullanılmaya başlanmıştır. 2013 yılından itibaren müfredatlar ve uyum programları MÜDEK standartlarına uygun olarak; Temel Bilimler, Mesleki Dersler (Mühendislik) ve Genel Dersler olarak sınıflandırılmış; derslerin bu sınıflara göre AKTS ve kredi değerlerine ders müfredatlarında yer verilmiştir. Ayrıca bu kapsamda “Ders Dosyaları Hazırlama Sistemine” pilot olarak geçilmiş olup seçilen dersler için “Ders Dosyaları” MÜDEK standartlarına uygun olarak hazırlanmıştır. Bölümün bağlı bulunduğu fakültesini ismi 2015 yılında Mühendislik Fakültesi olarak değişmiştir. 2016 yılında bölümün eğitim dilinin %30 İngilizce olmasına karar verilmiştir.
Son üç dönem dönemde bölüm başkanlığı yapan öğretim üyeleri aşağıdaki gibidir:
Prof. Dr. Sibkat KAÇTIOĞLU (2014- devam ediyor)
Prof. Dr. Kemal VAROL (2013-2014)
Prof. Dr. Osman YAZICIOĞLU (2011-2013)